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唇裂的原因目前尚未得到明确的答案，据研究表明可能与以下因素有关：
1 唇裂的遗传因素：唇裂的患者可发现在其直糸亲属或旁糸亲属中也有类似的畸形发生，因而认为唇裂畸形与遗传有一定的关系。流行病学调查表明：直系亲属中有唇裂畸形者，其后代的唇裂发生率比亲属中无辰裂畸形者要高。遗传学研究还认为唇裂属于多基因遗传性疾病。
2 唇裂的环境因素：唇裂主要是母亲怀孕早期(怀孕3个月以前)由以下的某种原因而导致宝宝唇裂：如怀孕期间营养缺乏，感染和损伤，内分泌的影响，药物因素，物理损伤，烟酒因素等。
3 唇裂的年龄因素：来自丹麦的研究人员发现，年龄偏大的父母会使婴儿的“唇裂”几率增加。新生儿患“唇裂”的风险随父母双方的年龄递增。40岁母亲与30岁母亲相比，新生儿患“唇裂”的风险要高20%;而20岁到50岁之间，父亲的年龄每大10岁，新生儿患“唇裂”的风险就增加12%。但是，如果父母中有一方极其年轻，就不存在这个规律了。
