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医学研究者还没有真正解开婴儿唇裂的原因，但部分研究结果表明唇裂与遗传因素和宫内环境因素有密切的关系。
婴儿唇裂原因的可能因素是：
营养因素：早孕期的呕吐，厌食，偏食等导致维生素D、叶酸、铁、钙等的缺乏。
药物因素：如服用抗癫痫药、类胆固醇、抗过敏、抗癌药物等。
内分泌因素：精神性或损伤性的因素，如遭到强烈的精神刺激、身体外部遭损伤等。
病毒因素：如孕妇上呼吸道感染、风疹等。
还有很多其他因素：如照射X线、吸烟、酗酒、缺氧。另外，唇腭裂有相当部分是遗传的，一般唇腭裂发生在第一胎的概率为1/600，如果第一胎是唇腭裂的在第二胎发生唇腭裂的几率为3/100。
唇裂是可以在婴儿5个半月的时候通过彩超检查出来的，但是检查唇裂还要根据胎儿在母体中的体位。
首先胎儿的面部必须在母体的侧方或者前方，另外胎儿的头部附近要有充足的羊水。具备上述条件，90%的唇裂胎儿是可以检查出来的。
基础美专家提醒：父母双方的年龄越大，孩子患先天性唇裂的几率就越大，适当的育龄可以有效的避免婴儿唇裂的发生。
